세종대학교 건설환경공학과는 1997년 이공대학 공학부 내 토목공학전공으로 신설되어 첫 학부입학생을 선발하였다.

이듬해인 1998년 공과대학 토목환경공학과로 소속 및 학과명을 개편하고,

2000년 3월에는 대학원과정(석 · 박사)을 신설하여 4개 연구실에 대학원생을 선발하였다.

2010년에는 학과명을 건설환경공학과로 개편하였다.

2010년 현재 9명의 전임교수들은 독자적인 연구를 원칙으로 하여 각 연구실을 운영하고 있으며,

국가지정연구실, 건설기술연구소 및 물자원연구소를 통한 공동연구도 수행하고 있다.

2010년 현재 학부생 270명, 대학원생 59명이 재학하고 있다.